研究人员发现鹿携带SARS-CoV-2变体,这种变体在人类中已经灭绝

研究人员发现鹿携带SARS-CoV-2变体,这种变体在人类中已经灭绝

对SARS-CoV-2进行采样和测试的WTD人群的人口统计学。在纽约州(NY)狩猎第一季(2020年9月至12月,n=2700)和第二季(2021 9月至十二月,n=3762)期间,从自由放养的狩猎采集的WTD中采集咽后淋巴结(RPLN)样本。(A) 纽约州的抽样分布和阳性率。在第一季的17个样本(0.6%)和第二季的583个样本(21.1%)中检测到SARS-CoV-2 RNA。(B) 纽约州每个县第1季和第2季SARS-CoV-2阳性样本的比例。(C) 纽约WTD SARS-CoV-2感染的高风险地区或热点。对第二季的样本进行空间聚类分析(n=2762)。确定了19个空间簇(C1至C19),其中包含在彼此相距10.6至55km的半径内采集的3至57个阳性样本。图中突出了WTD中SARS-CoV-2感染高危的七个热点(相对风险[RR]>1.76)。(D) 在第一季和第二季期间,根据WTD的性别和年龄收集的样本总数。动物分为以下三个年龄组:小于1.5岁(小鹿)、≥1.5岁且小于2.5岁(一岁)和≥2.5岁(成年)。(E) SARS-CoV-2阳性样本数量——基于第一季和第二季WTD的性别和年龄。(F) 在第一季和第二季期间,基于WTD性别和年龄的阳性样本比例。资料来源:《美国国家科学院院刊》(2023)。DOI:10.1073/pnas.2215067120

(神秘的地球uux.cn)据美国物理学家组织网(作者:Cornell University):康奈尔大学的研究人员发现,北美数量最多的大型哺乳动物白尾鹿体内含有SARS-CoV-2变体,这种变体曾广泛传播,但在人类体内已不再存在。

随着科学家们不断收集和分析新的数据,鹿是否能成为这些过时变种的长期储存库仍然未知。

这项研究于1月31日发表在《美国国家科学院院刊》上,是迄今为止评估白尾鹿SARS-CoV-2流行率、遗传多样性和进化的最全面研究之一。

康奈尔大学人口医学和诊断科学副教授Diego Diel说:“这项研究最引人注目的发现之一是在这一野生动物种群中检测到三种致癌物-α、γ和δ-的共同循环。”。

在大流行过程中,鹿通过与人类的持续接触感染了SARS-CoV-2,可能来自狩猎、野生动物康复、喂养野生动物或通过废水或水源。

Diel说:“一种病毒在亚洲的人类身上出现,很可能是在从动物库溢出到人类体内之后,显然,或可能是在北美发现了一种新的野生动物库。”。

研究中使用的5700个样本是在2020-22年间在纽约收集的。

当研究人员将在鹿中发现的变体的基因组序列与从纽约各地的人类身上获得的相同变体的序列进行比较时,他们发现这些病毒在鹿中发生了变异,这表明这些变体可能已经在鹿中传播了好几个月。例如,当在鹿中检测到α和γ变体时,没有证据表明这些病毒株仍在人类中传播。事实上,当它们在鹿身上被发现时,在纽约的人类身上已经有四到六个月没有发现这两种变体。

迪尔说:“当我们将从白尾鹿中回收的病毒与人类序列进行序列比较时,我们观察到病毒基因组中有大量突变。”他补充说,与人类序列相比,一些病毒有多达80个突变,这进一步证明了病毒可能在鹿中传播了一段时间。这些突变表明,这种病毒已经适应了鹿,可能使它们之间的传播能力更强。

需要更多的研究来确认这些变异是否会随着时间的推移在鹿中消失,或者SARS-CoV-2是否有传播到其他野生动物(包括捕食者)的风险。

迪尔说:“由于我们研究中获得的证据,继续监测这些动物种群中的病毒非常重要,以真正了解和跟踪可能导致或有利于向人类和其他野生动物传播的变化。”。

据估计,美国有3000万只白尾鹿。Diel等人于2022年进行的一项研究发现,在2021调查的五个州中,40%的白尾鹿体内发现了SARS-CoV-2。




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