华大基因加盟“万种脊椎动物基因组计划”

2010年11月30日,深圳华大基因研究院与“万种脊椎动物基因组计划”联盟(G10KCOS)的科学家联合宣布启动万种脊椎动物基因组一期计划。该计划将依托华大基因先进的新一代测序技术平台、前沿的信息分析和数据处理能力,在未来两年内完成对101种脊椎动物的全基因组测序,解析其遗传密码。

Genome 10K计划被称为“基因组动物园”(Genome zoo),该计划拟绘制万种脊椎动物基因组图谱,建立哺乳类、鸟类、爬行类、两栖类和鱼类等10000种脊椎动物的遗传信息数据库,研究生物多样性和动物进化的机制,为生命科学和全球动物保护提供前所未有的基础资源。 该计划现有来自全球的43个研究机构和68位科学家参与其中。

目前,全球已公布的正在测序的脊椎动物物种已达120种。华大基因与G10KCOS的各物种的研究委员会(哺乳类、鸟类、爬行类、两栖类和鱼类)选择并启动了101种新物种的测序工作。筛选这些物种所依据的重要因素包括物种的特殊进化地位及其系统发育的多样性、是否具有与人类有密切相关的生物学特性、该物种研究团队的综合实力和是否可以得到高质量样品等。华大基因将采用新一代高通量测序技术对这101种脊椎动物进行测序,并构建不同物种间的系统进化树。正在进行测序的物种以及新测序的物种信息详情请浏览 www.ldl.genomics.cn

华大基因与G10KCOS将共同致力于构建高质量的基因组图谱,提供便于数据浏览的信息平台并促进与基因组学相关各物种的研究。完成对全球221种脊椎动物的全基因组测序将成为向破译1万种脊椎动物基因组宏伟目标迈出的第一步【1】,该项目列表中的物种也将随着收集到的新物种材料及获得的资金支持而不断更新。科学家们将对计划列表中新物种的全基因组序列进行高效的组装、注释和分析,并于全基因组序列完成后的18个月内在线公布相关数据。华大基因与G10KCOS欢迎全球更多的科学家加入,启动更多有价值的新物种的全基因组测序工作,一起实现这个伟大的计划。

2011年3月13-19日,“万种脊椎动物基因组计划”将在美国加利福尼亚州圣克鲁兹举办研讨会,继续征集测序物种提案并公开相关的物种信息,讨论基因组序列组装中会遇到的挑战,研究短序列及长片断整合组装的有效分析途径。华大基因于今年1月正式启动“千种动植物基因组计划”,预计在未来两年内破译千种具有重要经济和科研价值的动植物基因组,构建一个全球最大的基因组数据库,为进一步研究各物种提供重要基础和依据。截至目前已启动了100多种动植物的基因组测序分析项目,其中近一半已完成或接近尾声,接下来的工作将进一步扩大和挖掘重要的物种资源,搜集重要的样本。与G10KCOS的合作将对动植物基因组研究的推进具有里程碑式的意义。

华大基因执行总裁王俊教授说:“依靠国际先进水平的测序技术平台和强大的生物信息分析能力,华大基因启动了‘千种动植物基因组计划’。此次参与‘万种脊椎动物基因组计划’,是华大基因在基因组学研究中不懈努力的体现,并将为全球基因组学研究水平的发展以及基因组学相关产业的发展做出重大贡献。”

“万种脊椎动物基因组计划”的主要负责人之一、国立癌症研究所遗传多样性研究主席Stephen J. O'Brien表示:“完成100个新的脊椎动物的全基因组序列组装及注释,是‘万种脊椎动物计划’的第一个1%’,我们将加速实现为生物学研究者提供一本完整的脊椎动物DNA密码解析书的目标。”


EurekAlert!





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