Load mobile navigation

用高品质多孔鹿角珊瑚基因组连同环境数据来研究这种珊瑚对气候变化的各种反应

用高品质多孔鹿角珊瑚基因组连同环境数据来研究这种珊瑚对气候变化的各种反应

用高品质多孔鹿角珊瑚基因组连同环境数据来研究这种珊瑚对气候变化的各种反应(PHOTO: ERIC MASON/AUSTRALIAN INSTITUTE OF MARINE SCIENCE

(神秘的地球uux.cn报道)据EurekAlert!:在一种新的保护基因学方法中,研究人员用高品质Acropora millepora(多孔鹿角珊瑚)基因组连同环境数据来研究这种珊瑚对气候变化的各种反应,该珊瑚的这种特性在保护中具突出的重要性。他们的结果提示,可能被漂白的珊瑚的独特基因性征可被用于提前预告可能的漂白事件,确认最易受到未来气候变暖影响的珊瑚种群或最能耐受这种影响的珊瑚群体。

当海水温度过热时,珊瑚会逐出生活在其组织内的至关重要的光合藻类,导致珊瑚变白(或“漂白”)及最终死亡。然而,珊瑚所能耐受的温度极限及它们对漂白事件的反应存在物种内差异。尽管人们认为,珊瑚的这类耐受性可部分遗传,但由于缺乏珊瑚物种的高品质基因组资源,其相关基因仍然难以捉摸。

为确定与漂白有关的任何潜在基因变异株,Zachary Fuller 和同事首先制作了A. millepora(一种易被漂白的浅水珊瑚)的染色体层级的基因组集合,并将其与全基因组关联(GWAS)数据进行了比较;这些数据来自其它213个A. millepora珊瑚群落,它们是在大堡礁某次漂白事件中采集的。

尽管 Fuller 等没有发现与漂白直接相关的特定基因变异株,但他们却能证明,一种由整个珊瑚基因组信号组成的多基因风险评分可用来预测野生珊瑚受到漂白的可能性。这些分析还揭示了sacsin基因中存在相当大量的基因多样性,而该基因与热应激反应有关。该多样性提示了基因对局部环境做出的适应性改变。

Rachael Bar 和 Leslie Guerrero在相关的《视角》中写道:“Fuller等人用长读技术处理重复区域所创建的基因组将会成为未来研究珊瑚生态学、演化及细胞生物学与发育的巨大资源,它会对过去难具说服力的对这一重要生态系统的研究有帮助。”




欢迎关注微信公众号“环球趣视频”
上一篇 下一篇 TAG: 基因组 气候 珊瑚