海底泥浆火山可能是温室气体甲烷的主要排放来源。其中的一些气体被名叫“嗜甲烷菌”（methanotroph）的微生物消耗掉了，但相对来说很少有微生物能利用甲烷，而且相关的过程也不是很清楚。对巴伦支海中一个泥浆火山周围的水域所做的一项研究工作，识别出三个关键的“嗜甲烷菌”群略：需氧细菌、生活在管虫之下的厌氧古细菌、以及以前未被描述过的与细菌垫相关的古细菌。研究人员还发现了微生物甲烷过滤容量的一个自然高限：不含硫酸盐和氧气的火山流体的向上流动限制了甲烷氧化的效率，使大部分甲烷能够逃逸到水圈，并有可能逃逸到大气中。
