有自然选择压力的基因的筛选
关于自然选择的研究往往是采用比较的方法：通过比较不同个体或物种中同源核苷序列来识别被选择的基因。一种基于密码子不稳定性的新的研究方法，允许对整个一个基因组进行扫描，来寻找那些相对于整个基因组来说氨基酸取代压力明显更大或更小的基因。如果一个基因含有许多有氨基酸取代压力的官能团，那么这些官能团上所产生的密码子平均将会表现出更高的不稳定性，因为它们的祖先密码子为不同氨基酸编码。这种方法通过对“分支杆菌”（M. tuberculosis）和“疟原虫”（P. falciparum）的整个基因组中每个基因上的选择性的相对强度进行编目得到了验证。分析证实，“分支杆菌”中的多数抗原和“疟原虫”中的细胞粘附性表面蛋白，处在进行氨基酸取代的很强的选择压力下。但此项研究也发现了很多性质不明的蛋白，它们在以上每一种病原体中也受到强大的选择压力。这种估计选择压力的方法所需数据要比比较序列的分析方法所需数据少得多，可很容易应用于大量不同的已经测序的生物。
