更深入地研究基因组

对生物体的基因组进行测序已经不足以满足某些科研人员。 关于基因组资讯是如何被转化为细胞生长和组织发育程式（即实际在一个活体生物中所产生的步骤）仍然还有许多谜团有待解开。 因为这个原因，（编者按：美国）国立人类基因组研究院在2007年启动了modENCODE计划（modENCODE是model organism Encyclopedia of DNA Elements[即模型生物体DNA成分百科]的缩写）。 现在，研究人员说，这一努力已经对2种模型生物（即线虫和果蝇）是如何转录其DNA并表达它们的基因以求生存的有了重要的见解。 由于这两则对线虫和果蝇的研究披露了如此多的与人类基因组相重叠的特性，研究人员说，modENCODE计划将也会引领人们更好地了解人类生物学。

Mark Gerstein及其同事对秀丽隐杆线虫（Caenorhabditis elegans）做了有关的尝试，并收集了在该线虫整个发育阶段中的237个在基因组范围内的与该生物基因结构、RNA表达及染色质调节等有关的数据集。他们对那些数据集进行了分析并产生了对个体基因以及它们的转录和表达更为完整和精确的模型。在平行研究中，modENCODE Consortium分析了超过700个的有关黑腹果蝇（Drosophila melanogaster）基因表达详细情况的数据集。他们的详细分析也披露了这些果蝇基因组的机体与功能之间的联系；研究人员说，他们的结果使得人们可以对基因功能、组织和发育阶段调节因子及基因表达水平做出比过去所获得的要更为精确的预测。这两则研究第一次发现了线虫和果蝇基因组的高度占据标靶区域（或称HOT区域）。在这些区域中，DNA被超过15种的不同的转录因子所束缚。总言之，这些对两种最重要的模型生物的基因表达程式的研究为人们提供了许多新的见解。一则由Mark Blaxter撰写的观点栏目对这些发现以及它们对人类健康和疾病的意涵进行了解释。

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