印度-西太平洋海洋生态系统支持全世界估计19,000种鱼类中的16%以上。Mora等人利用一个基于来自该地区70个地点的信息的地理数据库，对生态学上的中心问题之一、即生物多样性不均匀分布的原因进行了探讨。他们在印尼和菲律宾地区发现了一个礁石鱼多样性很高的中心，并发现鱼类从这一中心地区的向外扩散，既可解释物种丰富度所存在的大尺度梯度，又可解释局部群落的结构。所以，决定物种丰富度大尺度模式的物种分异、绝灭和扩散过程，似乎也决定局部群落中所存在的物种类别。因此，对印尼和菲律宾地区礁石鱼群的战略性保护，将会对保持整个印度洋和太平洋地区的生物多样性做出重要贡献。
