选择基因组测序物种的方法

迄今已被测序的细菌和古细菌基因组之所以被选择测序,主要是考虑到它们的生理问题。这种选择依据并没错,但却导致了明显的系统发育偏颇。在“细菌和古细菌基因组百科全书”(GEBA)项目中,研究人员采用了另一种方法,该方法主张根据生物的系统发育位置来选择基因组,其目的是填补在生命树的细菌和古细菌分支测序中的空白。这一方法的价值已被一项示范研究的成果证实,即选择用来扩大系统发育覆盖面的56个可培育物种基因组序列的发布。对这些序列进行分析,可提供系统发育、蛋白功能和基因组注解等方面的信息。


作者:田天
来源:科学时报





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