美国一项最新分析或可能开启发现上千种潜在新型癌症生物标记的大门
（神秘的地球报道）据凤凰科技（编译/严炎刘星）：科学日报报道，美国密西根大学综合性肿瘤中心的研究人员进行的一项最新分析或可能开启发现上千种潜在新型癌症生物标记的大门。他们分析了之前尚未被研究的基因组——长的非编码RNAs的全球分布。这部分人体基因组被认为是暗物质，因为科学家对它们的了解非常有限。最新证据表明lncRNAs可能在癌症中起着一定的作用，对它们的更好理解或可能导致改善癌症诊断、预后或者治疗的新潜在目标。
“我们知道蛋白质编码基因，但它只占据整个基因组的1-2%。而有关非编码基因的生物学原理，主要是它在人体疾病例如癌症里的功能，我们了解的却非常有限。” 密歇根大学医学院病理学S.P. Hicks教授(注: S.P. Hicks为荣誉)、密歇根大学平移病理学中心主任阿鲁尔•切奈言（Arul M. Chinnaiyan）博士这样说道。
研究人员使用了25个独立的数据集，总共包含7256份RNA序列样本。这一数据来自公共资源，例如癌症基因组阿特拉斯项目，以及密歇根大学平移病理学中心档案。他们使用了高通量测序技术以鉴别正常组织以及一系列常见癌症类型里58000多个lncRNA基因。这项研究被发表在期刊《自然遗传学》上。
“我们使用了所有数据来解译不同组织以及癌症里的基因组全貌，” 切奈言说道。“这打开了包含各种类型lncRNA的潘多拉的盒子，以调查哪些具有作为生物标记物的潜力。”这个名为MiTranscriptome compendium的完整数据集已经对公众开放，网址是www.mitranscriptome.org，以便科学界进行探索。
研究人员还确认了一种名为SChLAP1的lncRNA，它或可能是侵袭性前列腺癌症潜在的生物标记物。SChLAP1在转移性前列腺癌里高度表达，它主要存在前列腺癌细胞里，而不存在于其它癌细胞或者正常细胞里，这为研究人员提供了希望，或可以研发一种非侵入性的测试来检测SChLAP1。这样的测试可以被用于帮助医生和病人为早期前列腺癌做出治疗决策。
“这样的长的非编码RNAs往往特定于癌症，而编码蛋白质的基因则不然。这使得lncRNA成为研发生物标记物非常有前途的目标。” 切奈言表示。“我们希望研究人员将调查MiTranscriptome compendium并开始选择有前途的lncRNA进行深入研究。很可能一些lncRNA子集具有这些功能，只不过它们从被未研究过，它就是具有这样巨大的潜力。”这项研究得到了美国国立癌症研究所、美国国防部、前列腺癌基金会、霍华德休斯医学研究所、美国癌症协会和A.艾尔弗雷德塔伯曼医学研究所的拨款资助。
