ABI 3700基因测序仪尚有不足

英国桑格研究中心的Mullikin和McMurray在Tech.Sight栏目发表文章评价ABI 3700 DNA分析仪的性能。Craig Venter希望借助该“大为超前”的基因测序仪使他的公司在三年内绘制出人类基因组的所有图谱。作者说,尽管该测序仪“对用户非常友好”,但要用于大规模测序操作,仍需对其进行“优化”。他们用ABI 3700对来自不同基因组的142个兆碱基对进行了测序试验,其中包括人类基因组的78个兆碱基对。与常用的测序仪相比,ABI 3700测序仪“没有马上提高测量的流通量”。由于组装相对少的长DNA片段比组装许多短的DNA片段要容易一些,对给定的DNA样品,研究者希望测序仪能读入尽可能多的碱基对。换句话说,仪器的“识别长度”比测序速度更重要。作者说:“对同一类型的样品进行测序,目前ABI 3700测序仪的读入长度比传统测序仪的读入长度要短。”ABI 3700的另一问题是它目前仅能测量用一种商业化学过程制备的样品,然而人们通常需要用其他化学过程制备样品。




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